Moss proteasome and ubiquitine pathwayns 
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 Dr. Pierre-Alain Girod (jusqu'en 1999)

adresse actuelle: Laboratoire de Biotechnologie Moléculaire UNIL-EPFL, 1015 Lausanne

 Dr. Christian Richard (jusqu'en 1999)

adresse actuelle: Laboratoire Cantonal (Canton de Vaud) - Epalinges

A l'occasion de notre étude du protéasome de la mousse Physcomitrella patens, nous avons achevé la reconstruction en 3D du protéasome 20S de mousse à partir des images de cryo-microscopie obtenues précédemment (en collaboration avec l’équipe du LAU – Prof. J. Dubochet). Il apparaît que les deux extrémités sont distinctes et que la particule est donc orientée. Par ailleurs, nous avons effectué une analyse structure/fonction de la sous-unité zêta du protéasome 20S par complémentation du mutant nul DOA5 de S. cerevisiae avec différentes versions du gène zêta de P. patens, dont il ressort que la région N-ter ainsi qu'un court domaine interne, constitué d’acides aminés acides et localisé à l’interface du canal central, sont essentiels à la survie de S. cerevisiae. En revanche, la suppression de l'extrémité C-ter de la protéine n’affecte pas la croissance de S. cerevisiae.

Notre étude du facteur Mcb1 (sous unité du protéasome 26S) s’est poursuivie avec l’analyse du mutant "knockout " de P. patens, en particulier par la complémentation de ce mutant avec différentes versions du gène Ppmcb1. Nous avons aussi analysé l'effet des cytokinines et des auxines sur la formation et le développement des gamétophores chez KOMCB1 et le type sauvage. Rappelons ici que le mutant KOMCB1 est, chez les eucaryotes, le premier mutant de ce type qui manifeste un phénotype caractéristique.

Dans le cadre de ce projet, le Dr P.A. Girod a contribué de manière significative à l’avancement de nos connaissances sur la recombinaison homologue chez Physcomitrella patens.

Articles :

Pierre-Alain Girod, Hongyong Fu, Jean-Pierre Zryd, and Richard D.Vierstra, (1999) "Multiubiquitin Chain Binding Subunit MCB1 (RPN10) of the 26S Proteasome Is Essential for Developmental Progression in Physcomitrella patens." The Plant Cell 11 (1999): 1457-1471 .

Hongyong Fu, Pierre-Alain Girod, Jed H.Doelling, Steven vasn Nocker, Mark Hochstrasser, Daniel Finley& Richard Vierstra, 1999 "Structure and Functionnal Analyses of the 26S Proteasome Subunits from Plants" Molecular Biology Reports 26: 137-146

Thèse :

"Le protéasome de Physcomitrella patens" - chap 1 - Christian Richard PhD thesis, Lausanne June 1999. Others chapters: 2 , 3 , 4-1 & 4-2 (ca 1 + 3 Mb!) , 5 (ca 3 Mb!) , 6, 7 and 8; in French, in pdf format (150-450 kb).