Cours de 2e cycle, "Module de Biologie et Génétique des plantes", semestre d'hiver 2003-2004

Cours de 2e cycle, "Module de biochimie et biotechnologie végétales", semestre d'été 2004 


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Par commodité, les documents concernant les cours de l'année académique 2003-2004 resterons disponibles jusqu'à fin 2005.

Ces documents ne sont plus valables pour les modules actuels- 2004-2005

Cours de 2e cycle, "Module de Biologie et Génétique des plantes", semestre d'hiver 2003 - 2004

14 leçons de 2 heures (y compris séminaires des étudiants)  - les lundis dès 13h30 à la salle 459 du CP

Premier cours le lundi 20 octobre 2003

Documents d'accompagnement du cours - (site réservé: vous avez besoin de votre nom d'utilisateur et mot de passe de l'UNIL)

A. L'organisation du génome nucléaire végétal

Le génome des plantes : taille et complexité, structure de la chromatine et du noyau ; les ADN répétitifs et les ADN mobiles (éléments transposables) ; quelques exemples de génomes connus (Arabidopsis, blé, tomate, etc...) - 3 leçons.
La réplication de l'ADN et la régulation de la division cellulaire. Mutations (éléments mutateurs, mutagenèse chimique et physique) et variations du génome (polyploïdie, allopolyploïdie). Réarrangements chromosomiques, crossing-over méiotiques et mitotiques, recombinaison - 3 leçons.

B. Génomes chloroplastiques et mitochondriaux.

L'hérédité monoparentale, structures des génomes du chloroplaste et de la mitochondrie végétale. Origine et évolution des cp et mt ADN. Répartition des fonctions entre noyau et organelles, régulation et interactions entre génomes - 3 leçons.

C. Epigénétique

La méthylation de l'ADN et le développement des végétaux, paramutations et interactions alléliques, les mécanismes de silençage de l'expression génétique - 3 leçons.

D. La génétique à un gène (transformation génique)

Les principes de la transformation génétique chez les végétaux (transformations chimiques, biolistique, basée sur A. tumefaciens) ; la conception et la construction des vecteurs de transformation. L'intégration de l'ADN étranger : recombinaisons homologue et hétérologue. Les problèmes liés à la stabilité et à l'expression des transgènes- 3 leçons

Livre d'accompagnement du cours:

Biochemistry & Molecular Biology of Plants - Bob Buchanan, Wilhem Gruissem, Russel Johns (American Society of Plant Physiologist, Rockville, Maryland USA -2000) - commande en ligne
Le plus récent ouvrage de biologie végétale, traitant de nombreux thèmes abordés dans le cours et bien d'autres

JPZ année académique 2003 - 2004


Cours de 2e cycle, "Module de Biochimie et de Biotechnologie végétales", semestre d'été 2004

1er cours: le lundi 22 mars 2004 à 14h15 (CP1 429)

Thème 1: les cultures de tissus végétaux, micropropagation , embryogenèse, hybridation somatiques, cryoconservation, etc ...

Thème 2 : la production de métabolites secondaires par les cultures de tissus végétaux

Thème 3 : les plantes transgéniques

Ce cours est accompagné de lectures conseillées dont voici la liste :

  1. Cultures de cellules, tissus et organes végétaux: fondements théoriques et utilisations pratiques, Jean-Pierre Zrÿd - PPUR 1988 (ISDN 2-88074-152-1) - disponible à la bibliothèque.
  2. Plant tissue culture web site at the University of Minnesota
  3. Petite intro simple aux cultures de cellules, tissus et organes végétaux
  4. Plant tissue culture: an alternative for production of useful metabolite (ou sous forme de fichier HELP - pour Windows seulement, env 700 Kb).
  5. La biologie d'Agrobacterium tumefaciens et les mécanismes de transfert de l'ADN sont décrits dans un article du laboratoire de Patricia Zambryski & vous trouverez des détails mis à jour sur les protéines impliquées dans les échanges génétique avec les plantes dans l'article Tzvi Tzifra. Consulter le volume 133 (novembre 2003) de la revue Plant Physiology, pour une mise à jour concernant la transformation des plantes par Agrobacterium tumefaciens.
  6. Les papiers suivants de notre laboratoire sur Physcomitrella patens et le ciblage de gènes (recombinaison homologue & remplacement d'allèle ) sont à consulter, la problématique est bien analysée par H. Puchta (2002):

    Schaefer, D. G. and Zrÿd, J-P (2004) "Principles of targeted mutagenesis in Physcomitrella patens" chapitre d'un nouveau livre sous presse

    Schaefer, D. G. (2002) "A new moss genetics: targeted mutagenesis in Physcomitrella patens". Annual Rev. Plant Biol. (53), 477-501

    Schaefer, D. G. and Zrÿd, J-P (2001) "The moss Physcomitrella patens now and then". Plant Physiol. 127 (4), 1430-1438

    Schaefer D.G (2001) "Gene targeting in Physcomitrella patens" Current Opinion in Plant Biology 4:143-150

  7. A Report on Genetically Engineered Crops
  8. Rapport 2003 (fichier PDF localisé , env 5.5Mb) sur les OGM commercialisables intitulé "Genetically Modified (GM) Crops: molecular and regulatory details". Ce document est publié par le BATS (Centre for Biosafety and Transdisciplinary Sustainability Management)

Pour information:

Questions d'examens 2002